Gezondheid

Appenzellers hebben een levensverwachting van 11-13 jaar. Uitschieters van ouder dan 16 jaar zijn mogelijk. Zij hebben dus de langste levensverwachting van de verschillende Sennenrassen. Door het feit dat bij de start van de raszuiverheid fok dit ras de grootste groep vertegenwoordigers telde, gaat men er van uit dat daardoor weinig van inteelt sprake kon zijn.
Punten van aandacht zijn de gewrichten. Bij de fok moeten de ouders een HD- en PL(patella luxatie)onderzoek hebben gehad. Verder wordt er vaak een Elleboogdysplasie-onderzoek(ED) gedaan. Dit is echter niet verplicht.